北磺溪的溪水雖為合法灌溉用水,但因硫磺成分不利作物生長,農民在枯水期會優先引取清水溪與西勢溪水,僅在水量不足時,才以磺溪水作為補充。於三界壇一圳取水口與磺溪一圳、清水圳匯流處,可以清晰辨視水色的差異,就是最直觀的水質教育現場。
這套水利系統支撐了金山平原的水稻梯田,也孕育了筊白筍、甘藷、芋頭等特色作物。部分區域因地下水位高,稻田水深可達半個孩童身高,農人需鋪設木板耕作,反而形成獨特的田間地景。這些農業空間,同時也是青鱂魚、水甕菜、毛蟹等物種的棲地,構成「里山生態系」。
而與北磺溪主流截然不同,清水溪水質清澈、礦物含量低。三條支流——清水溪、西勢溪與多條山澗湧泉——在中下游不斷匯入,逐步稀釋磺溪水中的氧化鐵,也讓河床石色由深褐轉為淡黃,水草得以重新生長。
在下游,由北磺溪、清水溪與西勢溪共同沖積而成的金山清水濕地,成為鹹淡水交會的重要節點。水田型濕地、泥灘地與潮間帶交錯,使此地在近二十年間逐漸轉化為北海岸重要的候鳥棲地,過去曾記錄到東方白鸛、西伯利亞白鶴等水鳥的蹤跡。
對農民而言,清水溪的意義除了具有豐富的生態資源,還有其提供農業中賴以維生的灌溉水源。