面對解編的關渡濕地,難免會出現些許質疑的聲音,擔心解編之後濕地可能面臨開發行為,人為的介入將隨著管制層級削弱而逐漸增長,最後導致多年守護的濕地生態終在人們的開發下漸漸消亡;回到制度層面,也有人擔憂關渡的案例引起模仿效應,往後其他自然保留區在執行政策上遭遇瓶頸時,會不會又走向解編之路呢?最後,解編之後的關渡濕地,還有什麼潛在的威脅是沒有被發現的?種種原因,使解編後的關渡,仍讓政府與相關團體們摸不清這篇濕地的未來。
關於這些疑慮,一先老師指出,保育的觀念應該與時俱進,如果只是一味地限制人類的活動,「保育」二字不免顯得有些空泛,移除紅樹林,是解編的首要目的,以關渡的情況而言,中上游的淤積,導致嚴重的紅樹林擴張、濕地陸域化,才衍生出水鳥生存空間不足的問題,肆意滋長的紅樹林,不只影響到水鳥,以現今紅樹林擴張的速度,幾十年後淡水河河道縮減、阻塞,影響民生生活時,仍是得移除。